Protein–RNA interactions for Protein: Q99J31

Ophn1, Oligophrenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ophn1Q99J31 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ophn1Q99J31 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ophn1Q99J31 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ophn1Q99J31 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ophn1Q99J31 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ophn1Q99J31 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ophn1Q99J31 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ophn1Q99J31 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ophn1Q99J31 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ophn1Q99J31 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ophn1Q99J31 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ophn1Q99J31 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ophn1Q99J31 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ophn1Q99J31 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ophn1Q99J31 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ophn1Q99J31 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ophn1Q99J31 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ophn1Q99J31 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ophn1Q99J31 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ophn1Q99J31 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ophn1Q99J31 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ophn1Q99J31 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ophn1Q99J31 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ophn1Q99J31 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ophn1Q99J31 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ophn1Q99J31 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ophn1Q99J31 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ophn1Q99J31 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ophn1Q99J31 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ophn1Q99J31 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ophn1Q99J31 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ophn1Q99J31 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ophn1Q99J31 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ophn1Q99J31 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ophn1Q99J31 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ophn1Q99J31 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ophn1Q99J31 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ophn1Q99J31 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ophn1Q99J31 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ophn1Q99J31 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ophn1Q99J31 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ophn1Q99J31 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ophn1Q99J31 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ophn1Q99J31 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ophn1Q99J31 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ophn1Q99J31 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ophn1Q99J31 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ophn1Q99J31 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ophn1Q99J31 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ophn1Q99J31 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ophn1Q99J31 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ophn1Q99J31 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ophn1Q99J31 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ophn1Q99J31 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ophn1Q99J31 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ophn1Q99J31 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ophn1Q99J31 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ophn1Q99J31 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ophn1Q99J31 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ophn1Q99J31 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ophn1Q99J31 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ophn1Q99J31 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ophn1Q99J31 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ophn1Q99J31 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ophn1Q99J31 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ophn1Q99J31 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ophn1Q99J31 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ophn1Q99J31 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ophn1Q99J31 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ophn1Q99J31 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ophn1Q99J31 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ophn1Q99J31 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ophn1Q99J31 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ophn1Q99J31 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ophn1Q99J31 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ophn1Q99J31 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ophn1Q99J31 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ophn1Q99J31 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ophn1Q99J31 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ophn1Q99J31 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ophn1Q99J31 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ophn1Q99J31 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ophn1Q99J31 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ophn1Q99J31 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ophn1Q99J31 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ophn1Q99J31 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ophn1Q99J31 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ophn1Q99J31 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ophn1Q99J31 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ophn1Q99J31 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ophn1Q99J31 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ophn1Q99J31 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ophn1Q99J31 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ophn1Q99J31 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ophn1Q99J31 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ophn1Q99J31 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ophn1Q99J31 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ophn1Q99J31 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ophn1Q99J31 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ophn1Q99J31 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms