Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf144aQ925F3 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf144aQ925F3 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf144aQ925F3 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Rnf144aQ925F3 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Rnf144aQ925F3 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf144aQ925F3 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf144aQ925F3 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf144aQ925F3 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf144aQ925F3 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf144aQ925F3 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf144aQ925F3 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf144aQ925F3 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf144aQ925F3 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf144aQ925F3 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Rnf144aQ925F3 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf144aQ925F3 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf144aQ925F3 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf144aQ925F3 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf144aQ925F3 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf144aQ925F3 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf144aQ925F3 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf144aQ925F3 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Rnf144aQ925F3 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Rnf144aQ925F3 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Rnf144aQ925F3 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
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Rnf144aQ925F3 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Rnf144aQ925F3 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Rnf144aQ925F3 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Rnf144aQ925F3 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Rnf144aQ925F3 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Rnf144aQ925F3 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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