Protein–RNA interactions for Protein: Q923B3

Nrif1, Neurotrophin receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrif1Q923B3 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms