Protein–RNA interactions for Protein: Q920N1

Odf3, Outer dense fiber protein 3, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf3Q920N1 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
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Odf3Q920N1 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Odf3Q920N1 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Odf3Q920N1 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Odf3Q920N1 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Odf3Q920N1 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Odf3Q920N1 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Odf3Q920N1 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Odf3Q920N1 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Odf3Q920N1 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Odf3Q920N1 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
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