Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZZ3

Sncb, Beta-synuclein, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SncbQ91ZZ3 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SncbQ91ZZ3 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SncbQ91ZZ3 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SncbQ91ZZ3 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SncbQ91ZZ3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SncbQ91ZZ3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SncbQ91ZZ3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SncbQ91ZZ3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SncbQ91ZZ3 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SncbQ91ZZ3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SncbQ91ZZ3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SncbQ91ZZ3 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SncbQ91ZZ3 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SncbQ91ZZ3 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SncbQ91ZZ3 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SncbQ91ZZ3 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SncbQ91ZZ3 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SncbQ91ZZ3 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SncbQ91ZZ3 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SncbQ91ZZ3 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SncbQ91ZZ3 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SncbQ91ZZ3 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SncbQ91ZZ3 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SncbQ91ZZ3 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SncbQ91ZZ3 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SncbQ91ZZ3 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SncbQ91ZZ3 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SncbQ91ZZ3 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SncbQ91ZZ3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SncbQ91ZZ3 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SncbQ91ZZ3 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SncbQ91ZZ3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SncbQ91ZZ3 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SncbQ91ZZ3 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SncbQ91ZZ3 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SncbQ91ZZ3 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SncbQ91ZZ3 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SncbQ91ZZ3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SncbQ91ZZ3 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SncbQ91ZZ3 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SncbQ91ZZ3 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SncbQ91ZZ3 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SncbQ91ZZ3 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SncbQ91ZZ3 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SncbQ91ZZ3 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SncbQ91ZZ3 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SncbQ91ZZ3 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SncbQ91ZZ3 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SncbQ91ZZ3 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SncbQ91ZZ3 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SncbQ91ZZ3 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SncbQ91ZZ3 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SncbQ91ZZ3 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SncbQ91ZZ3 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SncbQ91ZZ3 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SncbQ91ZZ3 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SncbQ91ZZ3 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SncbQ91ZZ3 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SncbQ91ZZ3 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SncbQ91ZZ3 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SncbQ91ZZ3 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SncbQ91ZZ3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SncbQ91ZZ3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SncbQ91ZZ3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SncbQ91ZZ3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SncbQ91ZZ3 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SncbQ91ZZ3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SncbQ91ZZ3 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SncbQ91ZZ3 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SncbQ91ZZ3 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SncbQ91ZZ3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SncbQ91ZZ3 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SncbQ91ZZ3 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SncbQ91ZZ3 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SncbQ91ZZ3 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SncbQ91ZZ3 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SncbQ91ZZ3 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SncbQ91ZZ3 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SncbQ91ZZ3 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SncbQ91ZZ3 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SncbQ91ZZ3 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SncbQ91ZZ3 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SncbQ91ZZ3 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SncbQ91ZZ3 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SncbQ91ZZ3 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SncbQ91ZZ3 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SncbQ91ZZ3 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SncbQ91ZZ3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SncbQ91ZZ3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SncbQ91ZZ3 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SncbQ91ZZ3 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SncbQ91ZZ3 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SncbQ91ZZ3 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SncbQ91ZZ3 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SncbQ91ZZ3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SncbQ91ZZ3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SncbQ91ZZ3 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SncbQ91ZZ3 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SncbQ91ZZ3 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SncbQ91ZZ3 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms