Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR4

Nek8, Serine/threonine-protein kinase Nek8, mousemouse

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Length 698 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek8Q91ZR4 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nek8Q91ZR4 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nek8Q91ZR4 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nek8Q91ZR4 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nek8Q91ZR4 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nek8Q91ZR4 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nek8Q91ZR4 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nek8Q91ZR4 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nek8Q91ZR4 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nek8Q91ZR4 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nek8Q91ZR4 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek8Q91ZR4 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek8Q91ZR4 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek8Q91ZR4 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek8Q91ZR4 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek8Q91ZR4 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek8Q91ZR4 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek8Q91ZR4 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek8Q91ZR4 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek8Q91ZR4 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek8Q91ZR4 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek8Q91ZR4 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek8Q91ZR4 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek8Q91ZR4 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek8Q91ZR4 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek8Q91ZR4 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek8Q91ZR4 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek8Q91ZR4 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek8Q91ZR4 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek8Q91ZR4 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek8Q91ZR4 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek8Q91ZR4 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek8Q91ZR4 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek8Q91ZR4 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek8Q91ZR4 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek8Q91ZR4 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Nek8Q91ZR4 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek8Q91ZR4 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek8Q91ZR4 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek8Q91ZR4 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek8Q91ZR4 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek8Q91ZR4 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek8Q91ZR4 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek8Q91ZR4 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek8Q91ZR4 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek8Q91ZR4 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek8Q91ZR4 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek8Q91ZR4 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek8Q91ZR4 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek8Q91ZR4 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Nek8Q91ZR4 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek8Q91ZR4 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Nek8Q91ZR4 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Nek8Q91ZR4 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek8Q91ZR4 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Nek8Q91ZR4 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek8Q91ZR4 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek8Q91ZR4 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Nek8Q91ZR4 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Nek8Q91ZR4 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek8Q91ZR4 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek8Q91ZR4 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek8Q91ZR4 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek8Q91ZR4 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek8Q91ZR4 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms