Protein–RNA interactions for Protein: Q91YK2

Rrp1b, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1bQ91YK2 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms