Protein–RNA interactions for Protein: Q91XD2

Lims2, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims2Q91XD2 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lims2Q91XD2 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lims2Q91XD2 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lims2Q91XD2 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lims2Q91XD2 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lims2Q91XD2 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lims2Q91XD2 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lims2Q91XD2 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lims2Q91XD2 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lims2Q91XD2 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lims2Q91XD2 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lims2Q91XD2 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lims2Q91XD2 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lims2Q91XD2 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lims2Q91XD2 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lims2Q91XD2 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lims2Q91XD2 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lims2Q91XD2 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lims2Q91XD2 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lims2Q91XD2 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lims2Q91XD2 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lims2Q91XD2 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lims2Q91XD2 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lims2Q91XD2 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lims2Q91XD2 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lims2Q91XD2 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lims2Q91XD2 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lims2Q91XD2 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lims2Q91XD2 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lims2Q91XD2 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lims2Q91XD2 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lims2Q91XD2 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lims2Q91XD2 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lims2Q91XD2 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lims2Q91XD2 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lims2Q91XD2 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lims2Q91XD2 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lims2Q91XD2 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lims2Q91XD2 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lims2Q91XD2 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lims2Q91XD2 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lims2Q91XD2 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lims2Q91XD2 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lims2Q91XD2 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lims2Q91XD2 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lims2Q91XD2 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lims2Q91XD2 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lims2Q91XD2 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lims2Q91XD2 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lims2Q91XD2 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lims2Q91XD2 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lims2Q91XD2 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lims2Q91XD2 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lims2Q91XD2 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lims2Q91XD2 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lims2Q91XD2 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lims2Q91XD2 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lims2Q91XD2 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lims2Q91XD2 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lims2Q91XD2 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lims2Q91XD2 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lims2Q91XD2 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lims2Q91XD2 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lims2Q91XD2 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lims2Q91XD2 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lims2Q91XD2 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lims2Q91XD2 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lims2Q91XD2 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lims2Q91XD2 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lims2Q91XD2 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lims2Q91XD2 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lims2Q91XD2 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lims2Q91XD2 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lims2Q91XD2 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lims2Q91XD2 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lims2Q91XD2 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lims2Q91XD2 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lims2Q91XD2 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lims2Q91XD2 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lims2Q91XD2 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lims2Q91XD2 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Lims2Q91XD2 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lims2Q91XD2 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lims2Q91XD2 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lims2Q91XD2 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lims2Q91XD2 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lims2Q91XD2 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lims2Q91XD2 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lims2Q91XD2 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lims2Q91XD2 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lims2Q91XD2 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lims2Q91XD2 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lims2Q91XD2 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lims2Q91XD2 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lims2Q91XD2 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Lims2Q91XD2 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Lims2Q91XD2 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lims2Q91XD2 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Lims2Q91XD2 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lims2Q91XD2 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms