Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp3Q91W36 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms