Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHZ7

Imp4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein protein IMP4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Imp4Q8VHZ7 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Imp4Q8VHZ7 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Imp4Q8VHZ7 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Imp4Q8VHZ7 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Imp4Q8VHZ7 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Imp4Q8VHZ7 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Imp4Q8VHZ7 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Imp4Q8VHZ7 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Imp4Q8VHZ7 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Imp4Q8VHZ7 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Imp4Q8VHZ7 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Imp4Q8VHZ7 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Imp4Q8VHZ7 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Imp4Q8VHZ7 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Imp4Q8VHZ7 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Imp4Q8VHZ7 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Imp4Q8VHZ7 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Imp4Q8VHZ7 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Imp4Q8VHZ7 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Imp4Q8VHZ7 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Imp4Q8VHZ7 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Imp4Q8VHZ7 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Imp4Q8VHZ7 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Imp4Q8VHZ7 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Imp4Q8VHZ7 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Imp4Q8VHZ7 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Imp4Q8VHZ7 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Imp4Q8VHZ7 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Imp4Q8VHZ7 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Imp4Q8VHZ7 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Imp4Q8VHZ7 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Imp4Q8VHZ7 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Imp4Q8VHZ7 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Imp4Q8VHZ7 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Imp4Q8VHZ7 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Imp4Q8VHZ7 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Imp4Q8VHZ7 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Imp4Q8VHZ7 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Imp4Q8VHZ7 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Imp4Q8VHZ7 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Imp4Q8VHZ7 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Imp4Q8VHZ7 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Imp4Q8VHZ7 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Imp4Q8VHZ7 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Imp4Q8VHZ7 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Imp4Q8VHZ7 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Imp4Q8VHZ7 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Imp4Q8VHZ7 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Imp4Q8VHZ7 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Imp4Q8VHZ7 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Imp4Q8VHZ7 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Imp4Q8VHZ7 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Imp4Q8VHZ7 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Imp4Q8VHZ7 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Imp4Q8VHZ7 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Imp4Q8VHZ7 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Imp4Q8VHZ7 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Imp4Q8VHZ7 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Imp4Q8VHZ7 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Imp4Q8VHZ7 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Imp4Q8VHZ7 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Imp4Q8VHZ7 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Imp4Q8VHZ7 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Imp4Q8VHZ7 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Imp4Q8VHZ7 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Imp4Q8VHZ7 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Imp4Q8VHZ7 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Imp4Q8VHZ7 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Imp4Q8VHZ7 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Imp4Q8VHZ7 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Imp4Q8VHZ7 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Imp4Q8VHZ7 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Imp4Q8VHZ7 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Imp4Q8VHZ7 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Imp4Q8VHZ7 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Imp4Q8VHZ7 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Imp4Q8VHZ7 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Imp4Q8VHZ7 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Imp4Q8VHZ7 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Imp4Q8VHZ7 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Imp4Q8VHZ7 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Imp4Q8VHZ7 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Imp4Q8VHZ7 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Imp4Q8VHZ7 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Imp4Q8VHZ7 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Imp4Q8VHZ7 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Imp4Q8VHZ7 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Imp4Q8VHZ7 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Imp4Q8VHZ7 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Imp4Q8VHZ7 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Imp4Q8VHZ7 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Imp4Q8VHZ7 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Imp4Q8VHZ7 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Imp4Q8VHZ7 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Imp4Q8VHZ7 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Imp4Q8VHZ7 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Imp4Q8VHZ7 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Imp4Q8VHZ7 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Imp4Q8VHZ7 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Imp4Q8VHZ7 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms