Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE97

Srsf4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 489 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf4Q8VE97 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms