Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS7

Cep57l1, Centrosomal protein CEP57L1, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep57l1Q8VDS7 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cep57l1Q8VDS7 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cep57l1Q8VDS7 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cep57l1Q8VDS7 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cep57l1Q8VDS7 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cep57l1Q8VDS7 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cep57l1Q8VDS7 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cep57l1Q8VDS7 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cep57l1Q8VDS7 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cep57l1Q8VDS7 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cep57l1Q8VDS7 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cep57l1Q8VDS7 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cep57l1Q8VDS7 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cep57l1Q8VDS7 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cep57l1Q8VDS7 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cep57l1Q8VDS7 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cep57l1Q8VDS7 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cep57l1Q8VDS7 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cep57l1Q8VDS7 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cep57l1Q8VDS7 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cep57l1Q8VDS7 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cep57l1Q8VDS7 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cep57l1Q8VDS7 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cep57l1Q8VDS7 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cep57l1Q8VDS7 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cep57l1Q8VDS7 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cep57l1Q8VDS7 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cep57l1Q8VDS7 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cep57l1Q8VDS7 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cep57l1Q8VDS7 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cep57l1Q8VDS7 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cep57l1Q8VDS7 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cep57l1Q8VDS7 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cep57l1Q8VDS7 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cep57l1Q8VDS7 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cep57l1Q8VDS7 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cep57l1Q8VDS7 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cep57l1Q8VDS7 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cep57l1Q8VDS7 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cep57l1Q8VDS7 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cep57l1Q8VDS7 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cep57l1Q8VDS7 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cep57l1Q8VDS7 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cep57l1Q8VDS7 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cep57l1Q8VDS7 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cep57l1Q8VDS7 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cep57l1Q8VDS7 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cep57l1Q8VDS7 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cep57l1Q8VDS7 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cep57l1Q8VDS7 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cep57l1Q8VDS7 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cep57l1Q8VDS7 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cep57l1Q8VDS7 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cep57l1Q8VDS7 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cep57l1Q8VDS7 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cep57l1Q8VDS7 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cep57l1Q8VDS7 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cep57l1Q8VDS7 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cep57l1Q8VDS7 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cep57l1Q8VDS7 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cep57l1Q8VDS7 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cep57l1Q8VDS7 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cep57l1Q8VDS7 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cep57l1Q8VDS7 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cep57l1Q8VDS7 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cep57l1Q8VDS7 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cep57l1Q8VDS7 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cep57l1Q8VDS7 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cep57l1Q8VDS7 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cep57l1Q8VDS7 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cep57l1Q8VDS7 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cep57l1Q8VDS7 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cep57l1Q8VDS7 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cep57l1Q8VDS7 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cep57l1Q8VDS7 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cep57l1Q8VDS7 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cep57l1Q8VDS7 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cep57l1Q8VDS7 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cep57l1Q8VDS7 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cep57l1Q8VDS7 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cep57l1Q8VDS7 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cep57l1Q8VDS7 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cep57l1Q8VDS7 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cep57l1Q8VDS7 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cep57l1Q8VDS7 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cep57l1Q8VDS7 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cep57l1Q8VDS7 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cep57l1Q8VDS7 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cep57l1Q8VDS7 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cep57l1Q8VDS7 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cep57l1Q8VDS7 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cep57l1Q8VDS7 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cep57l1Q8VDS7 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cep57l1Q8VDS7 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cep57l1Q8VDS7 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cep57l1Q8VDS7 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cep57l1Q8VDS7 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cep57l1Q8VDS7 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cep57l1Q8VDS7 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cep57l1Q8VDS7 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms