Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS4

Rprd1a, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, mousemouse

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1aQ8VDS4 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
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Rprd1aQ8VDS4 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Rprd1aQ8VDS4 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rprd1aQ8VDS4 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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