Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDP2

UPF0428 protein CXorf56 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VDP2 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8VDP2 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8VDP2 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8VDP2 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8VDP2 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8VDP2 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8VDP2 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8VDP2 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8VDP2 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8VDP2 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8VDP2 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8VDP2 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8VDP2 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8VDP2 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8VDP2 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8VDP2 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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