Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB9

Slc6a20a, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3A, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20aQ8VDB9 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc6a20aQ8VDB9 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Slc6a20aQ8VDB9 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Slc6a20aQ8VDB9 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Slc6a20aQ8VDB9 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Slc6a20aQ8VDB9 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Slc6a20aQ8VDB9 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Slc6a20aQ8VDB9 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Slc6a20aQ8VDB9 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Slc6a20aQ8VDB9 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Slc6a20aQ8VDB9 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Slc6a20aQ8VDB9 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Slc6a20aQ8VDB9 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc6a20aQ8VDB9 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc6a20aQ8VDB9 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc6a20aQ8VDB9 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Slc6a20aQ8VDB9 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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