Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCZ8

Rpusd1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd1Q8VCZ8 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpusd1Q8VCZ8 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpusd1Q8VCZ8 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Rpusd1Q8VCZ8 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Rpusd1Q8VCZ8 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Rpusd1Q8VCZ8 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Rpusd1Q8VCZ8 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms