Protein–RNA interactions for Protein: Q8R373

Clmp, CXADR-like membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmpQ8R373 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ClmpQ8R373 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ClmpQ8R373 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClmpQ8R373 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClmpQ8R373 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ClmpQ8R373 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClmpQ8R373 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClmpQ8R373 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClmpQ8R373 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClmpQ8R373 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClmpQ8R373 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ClmpQ8R373 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClmpQ8R373 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClmpQ8R373 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClmpQ8R373 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClmpQ8R373 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClmpQ8R373 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClmpQ8R373 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClmpQ8R373 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClmpQ8R373 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClmpQ8R373 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClmpQ8R373 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClmpQ8R373 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClmpQ8R373 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClmpQ8R373 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClmpQ8R373 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClmpQ8R373 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClmpQ8R373 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClmpQ8R373 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClmpQ8R373 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClmpQ8R373 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClmpQ8R373 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClmpQ8R373 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClmpQ8R373 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClmpQ8R373 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClmpQ8R373 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClmpQ8R373 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClmpQ8R373 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClmpQ8R373 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClmpQ8R373 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClmpQ8R373 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClmpQ8R373 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClmpQ8R373 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClmpQ8R373 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClmpQ8R373 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ClmpQ8R373 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClmpQ8R373 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClmpQ8R373 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClmpQ8R373 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClmpQ8R373 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClmpQ8R373 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClmpQ8R373 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClmpQ8R373 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClmpQ8R373 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClmpQ8R373 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClmpQ8R373 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClmpQ8R373 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ClmpQ8R373 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClmpQ8R373 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClmpQ8R373 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClmpQ8R373 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClmpQ8R373 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClmpQ8R373 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClmpQ8R373 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClmpQ8R373 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClmpQ8R373 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClmpQ8R373 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClmpQ8R373 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClmpQ8R373 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ClmpQ8R373 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ClmpQ8R373 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ClmpQ8R373 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ClmpQ8R373 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClmpQ8R373 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClmpQ8R373 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClmpQ8R373 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClmpQ8R373 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClmpQ8R373 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClmpQ8R373 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClmpQ8R373 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ClmpQ8R373 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClmpQ8R373 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ClmpQ8R373 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClmpQ8R373 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClmpQ8R373 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClmpQ8R373 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClmpQ8R373 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClmpQ8R373 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClmpQ8R373 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClmpQ8R373 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClmpQ8R373 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClmpQ8R373 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClmpQ8R373 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClmpQ8R373 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClmpQ8R373 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClmpQ8R373 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClmpQ8R373 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClmpQ8R373 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClmpQ8R373 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClmpQ8R373 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms