Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Vmn1r200Q8R281 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Vmn1r200Q8R281 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Vmn1r200Q8R281 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
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Vmn1r200Q8R281 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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Vmn1r200Q8R281 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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Vmn1r200Q8R281 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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Vmn1r200Q8R281 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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Vmn1r200Q8R281 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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Vmn1r200Q8R281 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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Vmn1r200Q8R281 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
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Vmn1r200Q8R281 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r200Q8R281 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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