Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZY9

Sf3b4, Splicing factor 3B subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b4Q8QZY9 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sf3b4Q8QZY9 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms