Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZS5

Rnf183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf183Q8QZS5 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf183Q8QZS5 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf183Q8QZS5 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf183Q8QZS5 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf183Q8QZS5 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf183Q8QZS5 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf183Q8QZS5 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf183Q8QZS5 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf183Q8QZS5 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf183Q8QZS5 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf183Q8QZS5 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf183Q8QZS5 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf183Q8QZS5 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf183Q8QZS5 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf183Q8QZS5 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf183Q8QZS5 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf183Q8QZS5 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf183Q8QZS5 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf183Q8QZS5 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf183Q8QZS5 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf183Q8QZS5 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf183Q8QZS5 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf183Q8QZS5 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf183Q8QZS5 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf183Q8QZS5 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf183Q8QZS5 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf183Q8QZS5 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf183Q8QZS5 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf183Q8QZS5 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf183Q8QZS5 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf183Q8QZS5 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf183Q8QZS5 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf183Q8QZS5 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf183Q8QZS5 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf183Q8QZS5 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf183Q8QZS5 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf183Q8QZS5 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf183Q8QZS5 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf183Q8QZS5 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf183Q8QZS5 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf183Q8QZS5 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf183Q8QZS5 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf183Q8QZS5 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf183Q8QZS5 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf183Q8QZS5 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf183Q8QZS5 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf183Q8QZS5 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf183Q8QZS5 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf183Q8QZS5 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf183Q8QZS5 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf183Q8QZS5 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf183Q8QZS5 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf183Q8QZS5 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf183Q8QZS5 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf183Q8QZS5 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf183Q8QZS5 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf183Q8QZS5 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf183Q8QZS5 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf183Q8QZS5 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf183Q8QZS5 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf183Q8QZS5 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf183Q8QZS5 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf183Q8QZS5 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf183Q8QZS5 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf183Q8QZS5 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf183Q8QZS5 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf183Q8QZS5 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf183Q8QZS5 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf183Q8QZS5 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf183Q8QZS5 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf183Q8QZS5 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf183Q8QZS5 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf183Q8QZS5 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf183Q8QZS5 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf183Q8QZS5 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf183Q8QZS5 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf183Q8QZS5 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf183Q8QZS5 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf183Q8QZS5 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf183Q8QZS5 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf183Q8QZS5 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf183Q8QZS5 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf183Q8QZS5 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf183Q8QZS5 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf183Q8QZS5 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf183Q8QZS5 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf183Q8QZS5 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73 ms