Protein–RNA interactions for Protein: Q8K424

Trpv3, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 3, mousemouse

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv3Q8K424 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trpv3Q8K424 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trpv3Q8K424 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trpv3Q8K424 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trpv3Q8K424 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trpv3Q8K424 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trpv3Q8K424 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trpv3Q8K424 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trpv3Q8K424 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trpv3Q8K424 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Trpv3Q8K424 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trpv3Q8K424 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trpv3Q8K424 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trpv3Q8K424 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trpv3Q8K424 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trpv3Q8K424 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trpv3Q8K424 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trpv3Q8K424 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trpv3Q8K424 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trpv3Q8K424 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms