Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3P5

Cnot6, CCR4-NOT transcription complex subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot6Q8K3P5 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnot6Q8K3P5 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnot6Q8K3P5 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnot6Q8K3P5 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnot6Q8K3P5 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnot6Q8K3P5 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnot6Q8K3P5 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnot6Q8K3P5 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnot6Q8K3P5 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnot6Q8K3P5 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnot6Q8K3P5 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnot6Q8K3P5 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnot6Q8K3P5 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnot6Q8K3P5 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnot6Q8K3P5 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnot6Q8K3P5 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnot6Q8K3P5 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnot6Q8K3P5 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnot6Q8K3P5 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnot6Q8K3P5 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot6Q8K3P5 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot6Q8K3P5 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot6Q8K3P5 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot6Q8K3P5 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot6Q8K3P5 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot6Q8K3P5 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot6Q8K3P5 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot6Q8K3P5 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot6Q8K3P5 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot6Q8K3P5 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot6Q8K3P5 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot6Q8K3P5 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot6Q8K3P5 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot6Q8K3P5 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot6Q8K3P5 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot6Q8K3P5 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot6Q8K3P5 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot6Q8K3P5 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot6Q8K3P5 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot6Q8K3P5 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot6Q8K3P5 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot6Q8K3P5 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot6Q8K3P5 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot6Q8K3P5 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot6Q8K3P5 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot6Q8K3P5 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot6Q8K3P5 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot6Q8K3P5 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot6Q8K3P5 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot6Q8K3P5 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot6Q8K3P5 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot6Q8K3P5 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot6Q8K3P5 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot6Q8K3P5 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot6Q8K3P5 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot6Q8K3P5 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot6Q8K3P5 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot6Q8K3P5 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot6Q8K3P5 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot6Q8K3P5 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot6Q8K3P5 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot6Q8K3P5 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot6Q8K3P5 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot6Q8K3P5 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot6Q8K3P5 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot6Q8K3P5 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot6Q8K3P5 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot6Q8K3P5 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot6Q8K3P5 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot6Q8K3P5 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot6Q8K3P5 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot6Q8K3P5 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot6Q8K3P5 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot6Q8K3P5 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot6Q8K3P5 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot6Q8K3P5 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot6Q8K3P5 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot6Q8K3P5 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot6Q8K3P5 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnot6Q8K3P5 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnot6Q8K3P5 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnot6Q8K3P5 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnot6Q8K3P5 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnot6Q8K3P5 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnot6Q8K3P5 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnot6Q8K3P5 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnot6Q8K3P5 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnot6Q8K3P5 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnot6Q8K3P5 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnot6Q8K3P5 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnot6Q8K3P5 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnot6Q8K3P5 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnot6Q8K3P5 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnot6Q8K3P5 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnot6Q8K3P5 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnot6Q8K3P5 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnot6Q8K3P5 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnot6Q8K3P5 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnot6Q8K3P5 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnot6Q8K3P5 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.6 ms