Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brd3Q8K2F0 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms