Protein–RNA interactions for Protein: Q8K296

Mtmr3, Myotubularin-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr3Q8K296 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mtmr3Q8K296 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mtmr3Q8K296 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mtmr3Q8K296 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mtmr3Q8K296 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mtmr3Q8K296 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mtmr3Q8K296 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mtmr3Q8K296 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mtmr3Q8K296 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mtmr3Q8K296 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mtmr3Q8K296 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mtmr3Q8K296 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mtmr3Q8K296 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mtmr3Q8K296 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mtmr3Q8K296 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Mtmr3Q8K296 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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Mtmr3Q8K296 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Mtmr3Q8K296 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mtmr3Q8K296 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mtmr3Q8K296 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mtmr3Q8K296 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mtmr3Q8K296 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mtmr3Q8K296 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mtmr3Q8K296 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mtmr3Q8K296 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mtmr3Q8K296 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mtmr3Q8K296 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mtmr3Q8K296 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mtmr3Q8K296 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mtmr3Q8K296 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mtmr3Q8K296 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mtmr3Q8K296 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mtmr3Q8K296 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mtmr3Q8K296 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mtmr3Q8K296 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mtmr3Q8K296 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mtmr3Q8K296 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mtmr3Q8K296 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mtmr3Q8K296 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mtmr3Q8K296 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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Mtmr3Q8K296 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mtmr3Q8K296 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mtmr3Q8K296 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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Mtmr3Q8K296 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mtmr3Q8K296 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mtmr3Q8K296 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mtmr3Q8K296 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mtmr3Q8K296 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mtmr3Q8K296 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
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Mtmr3Q8K296 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mtmr3Q8K296 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mtmr3Q8K296 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mtmr3Q8K296 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mtmr3Q8K296 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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Mtmr3Q8K296 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mtmr3Q8K296 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mtmr3Q8K296 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Mtmr3Q8K296 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mtmr3Q8K296 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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Mtmr3Q8K296 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mtmr3Q8K296 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mtmr3Q8K296 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mtmr3Q8K296 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mtmr3Q8K296 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mtmr3Q8K296 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mtmr3Q8K296 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mtmr3Q8K296 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mtmr3Q8K296 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mtmr3Q8K296 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mtmr3Q8K296 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mtmr3Q8K296 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mtmr3Q8K296 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mtmr3Q8K296 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mtmr3Q8K296 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mtmr3Q8K296 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mtmr3Q8K296 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mtmr3Q8K296 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mtmr3Q8K296 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mtmr3Q8K296 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mtmr3Q8K296 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mtmr3Q8K296 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mtmr3Q8K296 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mtmr3Q8K296 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mtmr3Q8K296 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mtmr3Q8K296 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mtmr3Q8K296 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mtmr3Q8K296 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mtmr3Q8K296 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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