Protein–RNA interactions for Protein: Q8K284

Gtf3c1, General transcription factor 3C polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c1Q8K284 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c1Q8K284 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c1Q8K284 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c1Q8K284 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c1Q8K284 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c1Q8K284 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c1Q8K284 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c1Q8K284 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c1Q8K284 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c1Q8K284 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c1Q8K284 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c1Q8K284 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c1Q8K284 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c1Q8K284 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c1Q8K284 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c1Q8K284 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c1Q8K284 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c1Q8K284 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c1Q8K284 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c1Q8K284 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c1Q8K284 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c1Q8K284 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c1Q8K284 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c1Q8K284 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c1Q8K284 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c1Q8K284 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c1Q8K284 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c1Q8K284 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c1Q8K284 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c1Q8K284 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c1Q8K284 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c1Q8K284 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c1Q8K284 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c1Q8K284 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c1Q8K284 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtf3c1Q8K284 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtf3c1Q8K284 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtf3c1Q8K284 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtf3c1Q8K284 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtf3c1Q8K284 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtf3c1Q8K284 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtf3c1Q8K284 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtf3c1Q8K284 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtf3c1Q8K284 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtf3c1Q8K284 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtf3c1Q8K284 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtf3c1Q8K284 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtf3c1Q8K284 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtf3c1Q8K284 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtf3c1Q8K284 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtf3c1Q8K284 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtf3c1Q8K284 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtf3c1Q8K284 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtf3c1Q8K284 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtf3c1Q8K284 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtf3c1Q8K284 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtf3c1Q8K284 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtf3c1Q8K284 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtf3c1Q8K284 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtf3c1Q8K284 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtf3c1Q8K284 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Gtf3c1Q8K284 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtf3c1Q8K284 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gtf3c1Q8K284 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gtf3c1Q8K284 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Gtf3c1Q8K284 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gtf3c1Q8K284 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Gtf3c1Q8K284 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
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Gtf3c1Q8K284 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gtf3c1Q8K284 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gtf3c1Q8K284 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gtf3c1Q8K284 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gtf3c1Q8K284 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gtf3c1Q8K284 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gtf3c1Q8K284 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gtf3c1Q8K284 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gtf3c1Q8K284 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gtf3c1Q8K284 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gtf3c1Q8K284 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gtf3c1Q8K284 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gtf3c1Q8K284 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gtf3c1Q8K284 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gtf3c1Q8K284 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gtf3c1Q8K284 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gtf3c1Q8K284 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gtf3c1Q8K284 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gtf3c1Q8K284 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gtf3c1Q8K284 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gtf3c1Q8K284 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gtf3c1Q8K284 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gtf3c1Q8K284 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gtf3c1Q8K284 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Gtf3c1Q8K284 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gtf3c1Q8K284 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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