Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

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Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Abcf3Q8K268 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Abcf3Q8K268 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcf3Q8K268 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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