Protein–RNA interactions for Protein: Q8K243

Trim68, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM68, mousemouse

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Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim68Q8K243 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim68Q8K243 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim68Q8K243 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim68Q8K243 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim68Q8K243 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim68Q8K243 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim68Q8K243 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim68Q8K243 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim68Q8K243 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim68Q8K243 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim68Q8K243 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim68Q8K243 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim68Q8K243 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim68Q8K243 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim68Q8K243 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim68Q8K243 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim68Q8K243 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim68Q8K243 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim68Q8K243 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim68Q8K243 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim68Q8K243 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim68Q8K243 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim68Q8K243 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim68Q8K243 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim68Q8K243 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim68Q8K243 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim68Q8K243 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim68Q8K243 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim68Q8K243 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim68Q8K243 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim68Q8K243 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim68Q8K243 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim68Q8K243 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Trim68Q8K243 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim68Q8K243 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim68Q8K243 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim68Q8K243 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim68Q8K243 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim68Q8K243 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim68Q8K243 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim68Q8K243 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim68Q8K243 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim68Q8K243 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim68Q8K243 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim68Q8K243 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim68Q8K243 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim68Q8K243 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim68Q8K243 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim68Q8K243 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim68Q8K243 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim68Q8K243 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim68Q8K243 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim68Q8K243 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim68Q8K243 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim68Q8K243 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim68Q8K243 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim68Q8K243 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim68Q8K243 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim68Q8K243 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim68Q8K243 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim68Q8K243 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim68Q8K243 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim68Q8K243 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Trim68Q8K243 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Trim68Q8K243 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim68Q8K243 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim68Q8K243 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim68Q8K243 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim68Q8K243 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trim68Q8K243 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trim68Q8K243 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trim68Q8K243 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trim68Q8K243 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trim68Q8K243 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim68Q8K243 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim68Q8K243 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim68Q8K243 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim68Q8K243 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim68Q8K243 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim68Q8K243 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim68Q8K243 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim68Q8K243 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim68Q8K243 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim68Q8K243 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim68Q8K243 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim68Q8K243 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim68Q8K243 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim68Q8K243 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim68Q8K243 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim68Q8K243 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim68Q8K243 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim68Q8K243 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim68Q8K243 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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