Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ53

Trip10, Cdc42-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip10Q8CJ53 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trip10Q8CJ53 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms