Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LgsnQ8CIX8 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LgsnQ8CIX8 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LgsnQ8CIX8 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LgsnQ8CIX8 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LgsnQ8CIX8 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LgsnQ8CIX8 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LgsnQ8CIX8 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LgsnQ8CIX8 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LgsnQ8CIX8 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LgsnQ8CIX8 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LgsnQ8CIX8 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LgsnQ8CIX8 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LgsnQ8CIX8 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LgsnQ8CIX8 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LgsnQ8CIX8 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LgsnQ8CIX8 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LgsnQ8CIX8 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LgsnQ8CIX8 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LgsnQ8CIX8 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LgsnQ8CIX8 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LgsnQ8CIX8 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LgsnQ8CIX8 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LgsnQ8CIX8 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LgsnQ8CIX8 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LgsnQ8CIX8 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LgsnQ8CIX8 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LgsnQ8CIX8 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LgsnQ8CIX8 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LgsnQ8CIX8 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LgsnQ8CIX8 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LgsnQ8CIX8 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LgsnQ8CIX8 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LgsnQ8CIX8 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LgsnQ8CIX8 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms