Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIS0

Card11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Card11Q8CIS0 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Card11Q8CIS0 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Card11Q8CIS0 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Card11Q8CIS0 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Card11Q8CIS0 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Card11Q8CIS0 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Card11Q8CIS0 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Card11Q8CIS0 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Card11Q8CIS0 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Card11Q8CIS0 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Card11Q8CIS0 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Card11Q8CIS0 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Card11Q8CIS0 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Card11Q8CIS0 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Card11Q8CIS0 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Card11Q8CIS0 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Card11Q8CIS0 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Card11Q8CIS0 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Card11Q8CIS0 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Card11Q8CIS0 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Card11Q8CIS0 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Card11Q8CIS0 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Card11Q8CIS0 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Card11Q8CIS0 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Card11Q8CIS0 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Card11Q8CIS0 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Card11Q8CIS0 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Card11Q8CIS0 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Card11Q8CIS0 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Card11Q8CIS0 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Card11Q8CIS0 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Card11Q8CIS0 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Card11Q8CIS0 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Card11Q8CIS0 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Card11Q8CIS0 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Card11Q8CIS0 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Card11Q8CIS0 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Card11Q8CIS0 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Card11Q8CIS0 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Card11Q8CIS0 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Card11Q8CIS0 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Card11Q8CIS0 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Card11Q8CIS0 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Card11Q8CIS0 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Card11Q8CIS0 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Card11Q8CIS0 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Card11Q8CIS0 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Card11Q8CIS0 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Card11Q8CIS0 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Card11Q8CIS0 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Card11Q8CIS0 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Card11Q8CIS0 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Card11Q8CIS0 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Card11Q8CIS0 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Card11Q8CIS0 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Card11Q8CIS0 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Card11Q8CIS0 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Card11Q8CIS0 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Card11Q8CIS0 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Card11Q8CIS0 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Card11Q8CIS0 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Card11Q8CIS0 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Card11Q8CIS0 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Card11Q8CIS0 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms