Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIE4

Parp10, Poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp10Q8CIE4 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Parp10Q8CIE4 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Parp10Q8CIE4 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Parp10Q8CIE4 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Parp10Q8CIE4 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Parp10Q8CIE4 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Parp10Q8CIE4 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Parp10Q8CIE4 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Parp10Q8CIE4 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Parp10Q8CIE4 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Parp10Q8CIE4 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Parp10Q8CIE4 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Parp10Q8CIE4 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Parp10Q8CIE4 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Parp10Q8CIE4 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Parp10Q8CIE4 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Parp10Q8CIE4 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Parp10Q8CIE4 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Parp10Q8CIE4 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Parp10Q8CIE4 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Parp10Q8CIE4 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Parp10Q8CIE4 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Parp10Q8CIE4 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Parp10Q8CIE4 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Parp10Q8CIE4 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Parp10Q8CIE4 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Parp10Q8CIE4 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Parp10Q8CIE4 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Parp10Q8CIE4 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Parp10Q8CIE4 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Parp10Q8CIE4 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Parp10Q8CIE4 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Parp10Q8CIE4 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Parp10Q8CIE4 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Parp10Q8CIE4 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Parp10Q8CIE4 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Parp10Q8CIE4 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Parp10Q8CIE4 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Parp10Q8CIE4 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Parp10Q8CIE4 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Parp10Q8CIE4 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Parp10Q8CIE4 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Parp10Q8CIE4 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Parp10Q8CIE4 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Parp10Q8CIE4 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Parp10Q8CIE4 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Parp10Q8CIE4 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Parp10Q8CIE4 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Parp10Q8CIE4 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Parp10Q8CIE4 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Parp10Q8CIE4 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Parp10Q8CIE4 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Parp10Q8CIE4 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Parp10Q8CIE4 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Parp10Q8CIE4 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Parp10Q8CIE4 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Parp10Q8CIE4 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Parp10Q8CIE4 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Parp10Q8CIE4 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Parp10Q8CIE4 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Parp10Q8CIE4 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Parp10Q8CIE4 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Parp10Q8CIE4 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Parp10Q8CIE4 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Parp10Q8CIE4 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Parp10Q8CIE4 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Parp10Q8CIE4 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Parp10Q8CIE4 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Parp10Q8CIE4 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Parp10Q8CIE4 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Parp10Q8CIE4 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Parp10Q8CIE4 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Parp10Q8CIE4 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Parp10Q8CIE4 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Parp10Q8CIE4 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Parp10Q8CIE4 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Parp10Q8CIE4 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Parp10Q8CIE4 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Parp10Q8CIE4 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Parp10Q8CIE4 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Parp10Q8CIE4 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Parp10Q8CIE4 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Parp10Q8CIE4 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Parp10Q8CIE4 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Parp10Q8CIE4 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Parp10Q8CIE4 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Parp10Q8CIE4 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Parp10Q8CIE4 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Parp10Q8CIE4 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Parp10Q8CIE4 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Parp10Q8CIE4 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Parp10Q8CIE4 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Parp10Q8CIE4 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Parp10Q8CIE4 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Parp10Q8CIE4 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Parp10Q8CIE4 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Parp10Q8CIE4 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Parp10Q8CIE4 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Parp10Q8CIE4 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Parp10Q8CIE4 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms