Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI96

Clip4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip4Q8CI96 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clip4Q8CI96 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clip4Q8CI96 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clip4Q8CI96 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clip4Q8CI96 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clip4Q8CI96 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clip4Q8CI96 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clip4Q8CI96 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clip4Q8CI96 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clip4Q8CI96 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clip4Q8CI96 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clip4Q8CI96 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clip4Q8CI96 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clip4Q8CI96 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clip4Q8CI96 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clip4Q8CI96 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clip4Q8CI96 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clip4Q8CI96 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clip4Q8CI96 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clip4Q8CI96 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clip4Q8CI96 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clip4Q8CI96 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clip4Q8CI96 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clip4Q8CI96 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clip4Q8CI96 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clip4Q8CI96 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clip4Q8CI96 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clip4Q8CI96 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Clip4Q8CI96 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Clip4Q8CI96 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clip4Q8CI96 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Clip4Q8CI96 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clip4Q8CI96 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clip4Q8CI96 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clip4Q8CI96 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clip4Q8CI96 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clip4Q8CI96 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clip4Q8CI96 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Clip4Q8CI96 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clip4Q8CI96 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Clip4Q8CI96 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clip4Q8CI96 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clip4Q8CI96 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clip4Q8CI96 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clip4Q8CI96 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clip4Q8CI96 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clip4Q8CI96 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clip4Q8CI96 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clip4Q8CI96 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clip4Q8CI96 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clip4Q8CI96 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clip4Q8CI96 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Clip4Q8CI96 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clip4Q8CI96 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clip4Q8CI96 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clip4Q8CI96 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Clip4Q8CI96 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clip4Q8CI96 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clip4Q8CI96 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clip4Q8CI96 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clip4Q8CI96 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clip4Q8CI96 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clip4Q8CI96 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clip4Q8CI96 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clip4Q8CI96 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clip4Q8CI96 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clip4Q8CI96 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clip4Q8CI96 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clip4Q8CI96 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clip4Q8CI96 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clip4Q8CI96 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clip4Q8CI96 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clip4Q8CI96 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clip4Q8CI96 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clip4Q8CI96 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clip4Q8CI96 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clip4Q8CI96 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clip4Q8CI96 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clip4Q8CI96 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clip4Q8CI96 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clip4Q8CI96 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clip4Q8CI96 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clip4Q8CI96 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clip4Q8CI96 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clip4Q8CI96 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clip4Q8CI96 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clip4Q8CI96 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clip4Q8CI96 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clip4Q8CI96 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clip4Q8CI96 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clip4Q8CI96 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clip4Q8CI96 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clip4Q8CI96 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clip4Q8CI96 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clip4Q8CI96 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clip4Q8CI96 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clip4Q8CI96 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clip4Q8CI96 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clip4Q8CI96 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clip4Q8CI96 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms