Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ercc8Q8CFD5 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ercc8Q8CFD5 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ercc8Q8CFD5 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ercc8Q8CFD5 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ercc8Q8CFD5 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ercc8Q8CFD5 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ercc8Q8CFD5 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ercc8Q8CFD5 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ercc8Q8CFD5 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ercc8Q8CFD5 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ercc8Q8CFD5 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ercc8Q8CFD5 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ercc8Q8CFD5 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Ercc8Q8CFD5 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Ercc8Q8CFD5 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ercc8Q8CFD5 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ercc8Q8CFD5 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ercc8Q8CFD5 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ercc8Q8CFD5 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ercc8Q8CFD5 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ercc8Q8CFD5 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ercc8Q8CFD5 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ercc8Q8CFD5 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ercc8Q8CFD5 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ercc8Q8CFD5 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ercc8Q8CFD5 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Ercc8Q8CFD5 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Ercc8Q8CFD5 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ercc8Q8CFD5 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ercc8Q8CFD5 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ercc8Q8CFD5 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ercc8Q8CFD5 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ercc8Q8CFD5 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ercc8Q8CFD5 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ercc8Q8CFD5 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ercc8Q8CFD5 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ercc8Q8CFD5 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ercc8Q8CFD5 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ercc8Q8CFD5 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ercc8Q8CFD5 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ercc8Q8CFD5 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
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Ercc8Q8CFD5 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ercc8Q8CFD5 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ercc8Q8CFD5 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ercc8Q8CFD5 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ercc8Q8CFD5 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ercc8Q8CFD5 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ercc8Q8CFD5 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
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Ercc8Q8CFD5 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ercc8Q8CFD5 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
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Ercc8Q8CFD5 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ercc8Q8CFD5 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ercc8Q8CFD5 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ercc8Q8CFD5 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
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Ercc8Q8CFD5 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ercc8Q8CFD5 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ercc8Q8CFD5 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ercc8Q8CFD5 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ercc8Q8CFD5 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ercc8Q8CFD5 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ercc8Q8CFD5 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ercc8Q8CFD5 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ercc8Q8CFD5 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ercc8Q8CFD5 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ercc8Q8CFD5 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ercc8Q8CFD5 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ercc8Q8CFD5 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ercc8Q8CFD5 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ercc8Q8CFD5 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ercc8Q8CFD5 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ercc8Q8CFD5 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ercc8Q8CFD5 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ercc8Q8CFD5 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ercc8Q8CFD5 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ercc8Q8CFD5 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ercc8Q8CFD5 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ercc8Q8CFD5 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ercc8Q8CFD5 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ercc8Q8CFD5 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ercc8Q8CFD5 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ercc8Q8CFD5 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ercc8Q8CFD5 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ercc8Q8CFD5 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
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