Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrrc9Q8CDN9 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrrc9Q8CDN9 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrrc9Q8CDN9 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrrc9Q8CDN9 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrrc9Q8CDN9 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrrc9Q8CDN9 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrrc9Q8CDN9 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrrc9Q8CDN9 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrrc9Q8CDN9 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrrc9Q8CDN9 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrrc9Q8CDN9 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrrc9Q8CDN9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrrc9Q8CDN9 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrrc9Q8CDN9 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrrc9Q8CDN9 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrrc9Q8CDN9 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrrc9Q8CDN9 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrrc9Q8CDN9 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrrc9Q8CDN9 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrrc9Q8CDN9 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrrc9Q8CDN9 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrrc9Q8CDN9 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrrc9Q8CDN9 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrrc9Q8CDN9 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrrc9Q8CDN9 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrrc9Q8CDN9 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrrc9Q8CDN9 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrrc9Q8CDN9 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrrc9Q8CDN9 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrrc9Q8CDN9 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrrc9Q8CDN9 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrrc9Q8CDN9 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrrc9Q8CDN9 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrrc9Q8CDN9 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrrc9Q8CDN9 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrrc9Q8CDN9 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrrc9Q8CDN9 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrrc9Q8CDN9 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrrc9Q8CDN9 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrrc9Q8CDN9 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrrc9Q8CDN9 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrrc9Q8CDN9 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrrc9Q8CDN9 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrrc9Q8CDN9 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrrc9Q8CDN9 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrrc9Q8CDN9 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrrc9Q8CDN9 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrrc9Q8CDN9 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrrc9Q8CDN9 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrrc9Q8CDN9 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrrc9Q8CDN9 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrrc9Q8CDN9 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrrc9Q8CDN9 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrrc9Q8CDN9 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrrc9Q8CDN9 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrrc9Q8CDN9 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrrc9Q8CDN9 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrrc9Q8CDN9 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrrc9Q8CDN9 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrrc9Q8CDN9 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrrc9Q8CDN9 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrrc9Q8CDN9 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrrc9Q8CDN9 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrrc9Q8CDN9 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrrc9Q8CDN9 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrrc9Q8CDN9 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrrc9Q8CDN9 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrrc9Q8CDN9 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrrc9Q8CDN9 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrrc9Q8CDN9 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrrc9Q8CDN9 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrrc9Q8CDN9 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrrc9Q8CDN9 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrrc9Q8CDN9 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Lrrc9Q8CDN9 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Lrrc9Q8CDN9 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrrc9Q8CDN9 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrrc9Q8CDN9 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrrc9Q8CDN9 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrrc9Q8CDN9 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrrc9Q8CDN9 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrrc9Q8CDN9 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrrc9Q8CDN9 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrrc9Q8CDN9 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrrc9Q8CDN9 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrrc9Q8CDN9 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrrc9Q8CDN9 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrrc9Q8CDN9 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrrc9Q8CDN9 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrrc9Q8CDN9 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrrc9Q8CDN9 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrrc9Q8CDN9 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrrc9Q8CDN9 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrrc9Q8CDN9 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrrc9Q8CDN9 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrrc9Q8CDN9 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrrc9Q8CDN9 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrrc9Q8CDN9 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrrc9Q8CDN9 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms