Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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