Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC27

Cacnb2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb2Q8CC27 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacnb2Q8CC27 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms