Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBA2

Slfn5, Schlafen family member 5, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn5Q8CBA2 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slfn5Q8CBA2 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slfn5Q8CBA2 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slfn5Q8CBA2 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slfn5Q8CBA2 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slfn5Q8CBA2 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slfn5Q8CBA2 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slfn5Q8CBA2 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slfn5Q8CBA2 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Slfn5Q8CBA2 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slfn5Q8CBA2 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Slfn5Q8CBA2 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slfn5Q8CBA2 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slfn5Q8CBA2 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slfn5Q8CBA2 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slfn5Q8CBA2 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slfn5Q8CBA2 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slfn5Q8CBA2 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slfn5Q8CBA2 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slfn5Q8CBA2 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slfn5Q8CBA2 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slfn5Q8CBA2 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slfn5Q8CBA2 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slfn5Q8CBA2 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slfn5Q8CBA2 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slfn5Q8CBA2 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slfn5Q8CBA2 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms