Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAT8

Fbxo48, F-box only protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo48Q8CAT8 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms