Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7W7

Dclre1b, 5' exonuclease Apollo, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclre1bQ8C7W7 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dclre1bQ8C7W7 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Dclre1bQ8C7W7 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Dclre1bQ8C7W7 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Dclre1bQ8C7W7 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Dclre1bQ8C7W7 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dclre1bQ8C7W7 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dclre1bQ8C7W7 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms