Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6J9

Nlrp4b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4bQ8C6J9 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrp4bQ8C6J9 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrp4bQ8C6J9 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrp4bQ8C6J9 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrp4bQ8C6J9 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrp4bQ8C6J9 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrp4bQ8C6J9 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrp4bQ8C6J9 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrp4bQ8C6J9 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrp4bQ8C6J9 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrp4bQ8C6J9 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrp4bQ8C6J9 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrp4bQ8C6J9 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrp4bQ8C6J9 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrp4bQ8C6J9 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrp4bQ8C6J9 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrp4bQ8C6J9 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrp4bQ8C6J9 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrp4bQ8C6J9 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrp4bQ8C6J9 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrp4bQ8C6J9 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrp4bQ8C6J9 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrp4bQ8C6J9 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrp4bQ8C6J9 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrp4bQ8C6J9 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrp4bQ8C6J9 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrp4bQ8C6J9 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrp4bQ8C6J9 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrp4bQ8C6J9 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrp4bQ8C6J9 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrp4bQ8C6J9 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrp4bQ8C6J9 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrp4bQ8C6J9 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrp4bQ8C6J9 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrp4bQ8C6J9 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrp4bQ8C6J9 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrp4bQ8C6J9 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrp4bQ8C6J9 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrp4bQ8C6J9 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrp4bQ8C6J9 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrp4bQ8C6J9 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrp4bQ8C6J9 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrp4bQ8C6J9 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrp4bQ8C6J9 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrp4bQ8C6J9 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrp4bQ8C6J9 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrp4bQ8C6J9 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrp4bQ8C6J9 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrp4bQ8C6J9 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrp4bQ8C6J9 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrp4bQ8C6J9 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrp4bQ8C6J9 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Nlrp4bQ8C6J9 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrp4bQ8C6J9 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrp4bQ8C6J9 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrp4bQ8C6J9 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrp4bQ8C6J9 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrp4bQ8C6J9 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrp4bQ8C6J9 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrp4bQ8C6J9 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrp4bQ8C6J9 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Nlrp4bQ8C6J9 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Nlrp4bQ8C6J9 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Nlrp4bQ8C6J9 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrp4bQ8C6J9 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrp4bQ8C6J9 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrp4bQ8C6J9 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrp4bQ8C6J9 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Nlrp4bQ8C6J9 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlrp4bQ8C6J9 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlrp4bQ8C6J9 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlrp4bQ8C6J9 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlrp4bQ8C6J9 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlrp4bQ8C6J9 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlrp4bQ8C6J9 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlrp4bQ8C6J9 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlrp4bQ8C6J9 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlrp4bQ8C6J9 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlrp4bQ8C6J9 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlrp4bQ8C6J9 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlrp4bQ8C6J9 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlrp4bQ8C6J9 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlrp4bQ8C6J9 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nlrp4bQ8C6J9 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nlrp4bQ8C6J9 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nlrp4bQ8C6J9 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nlrp4bQ8C6J9 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nlrp4bQ8C6J9 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nlrp4bQ8C6J9 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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