Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6E1

Apol7c, Apolipoprotein L 7c, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7cQ8C6E1 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apol7cQ8C6E1 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms