Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6A8

Bhlhe22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe22Q8C6A8 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Bhlhe22Q8C6A8 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bhlhe22Q8C6A8 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bhlhe22Q8C6A8 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bhlhe22Q8C6A8 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bhlhe22Q8C6A8 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Bhlhe22Q8C6A8 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bhlhe22Q8C6A8 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bhlhe22Q8C6A8 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bhlhe22Q8C6A8 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Bhlhe22Q8C6A8 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Bhlhe22Q8C6A8 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Bhlhe22Q8C6A8 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Bhlhe22Q8C6A8 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Bhlhe22Q8C6A8 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Bhlhe22Q8C6A8 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bhlhe22Q8C6A8 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bhlhe22Q8C6A8 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bhlhe22Q8C6A8 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bhlhe22Q8C6A8 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bhlhe22Q8C6A8 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Bhlhe22Q8C6A8 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bhlhe22Q8C6A8 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bhlhe22Q8C6A8 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bhlhe22Q8C6A8 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bhlhe22Q8C6A8 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bhlhe22Q8C6A8 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bhlhe22Q8C6A8 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms