Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2B3

Hdac7, Histone deacetylase 7, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac7Q8C2B3 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Hdac7Q8C2B3 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Hdac7Q8C2B3 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Hdac7Q8C2B3 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Hdac7Q8C2B3 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Hdac7Q8C2B3 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Hdac7Q8C2B3 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Hdac7Q8C2B3 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Hdac7Q8C2B3 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Hdac7Q8C2B3 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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