Protein–RNA interactions for Protein: Q8C176

Taf2, Transcription initiation factor TFIID subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf2Q8C176 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Taf2Q8C176 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Taf2Q8C176 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Taf2Q8C176 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Taf2Q8C176 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Taf2Q8C176 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Taf2Q8C176 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf2Q8C176 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf2Q8C176 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf2Q8C176 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf2Q8C176 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf2Q8C176 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf2Q8C176 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf2Q8C176 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf2Q8C176 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf2Q8C176 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf2Q8C176 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf2Q8C176 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf2Q8C176 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf2Q8C176 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf2Q8C176 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf2Q8C176 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf2Q8C176 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf2Q8C176 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf2Q8C176 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf2Q8C176 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf2Q8C176 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf2Q8C176 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf2Q8C176 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf2Q8C176 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf2Q8C176 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf2Q8C176 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf2Q8C176 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Taf2Q8C176 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Taf2Q8C176 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Taf2Q8C176 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Taf2Q8C176 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Taf2Q8C176 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Taf2Q8C176 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Taf2Q8C176 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Taf2Q8C176 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Taf2Q8C176 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Taf2Q8C176 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Taf2Q8C176 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Taf2Q8C176 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Taf2Q8C176 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Taf2Q8C176 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Taf2Q8C176 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Taf2Q8C176 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Taf2Q8C176 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Taf2Q8C176 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Taf2Q8C176 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Taf2Q8C176 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Taf2Q8C176 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Taf2Q8C176 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Taf2Q8C176 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Taf2Q8C176 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Taf2Q8C176 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Taf2Q8C176 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Taf2Q8C176 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Taf2Q8C176 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Taf2Q8C176 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Taf2Q8C176 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Taf2Q8C176 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Taf2Q8C176 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Taf2Q8C176 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Taf2Q8C176 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf2Q8C176 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf2Q8C176 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf2Q8C176 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf2Q8C176 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf2Q8C176 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf2Q8C176 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf2Q8C176 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf2Q8C176 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf2Q8C176 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf2Q8C176 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf2Q8C176 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf2Q8C176 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf2Q8C176 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf2Q8C176 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf2Q8C176 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf2Q8C176 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf2Q8C176 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf2Q8C176 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf2Q8C176 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf2Q8C176 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf2Q8C176 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf2Q8C176 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf2Q8C176 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf2Q8C176 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf2Q8C176 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf2Q8C176 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf2Q8C176 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf2Q8C176 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf2Q8C176 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf2Q8C176 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf2Q8C176 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf2Q8C176 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf2Q8C176 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms