Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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