Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV16

Zfp398, Zinc finger protein 398, mousemouse

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Length 643 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp398Q8BV16 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp398Q8BV16 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zfp398Q8BV16 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zfp398Q8BV16 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zfp398Q8BV16 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Zfp398Q8BV16 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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