Protein–RNA interactions for Protein: Q8BP99

UPF0500 protein C1orf216 homolog, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BP99 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q8BP99 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q8BP99 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q8BP99 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q8BP99 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q8BP99 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q8BP99 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q8BP99 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q8BP99 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q8BP99 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q8BP99 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Q8BP99 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q8BP99 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q8BP99 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q8BP99 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q8BP99 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q8BP99 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q8BP99 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q8BP99 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q8BP99 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q8BP99 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q8BP99 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q8BP99 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q8BP99 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Q8BP99 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q8BP99 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Q8BP99 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q8BP99 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Q8BP99 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q8BP99 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q8BP99 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q8BP99 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q8BP99 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q8BP99 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q8BP99 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q8BP99 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q8BP99 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q8BP99 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q8BP99 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q8BP99 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q8BP99 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q8BP99 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q8BP99 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q8BP99 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q8BP99 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q8BP99 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q8BP99 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q8BP99 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q8BP99 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q8BP99 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Q8BP99 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q8BP99 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Q8BP99 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q8BP99 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q8BP99 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q8BP99 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q8BP99 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q8BP99 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q8BP99 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q8BP99 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q8BP99 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q8BP99 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q8BP99 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q8BP99 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q8BP99 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q8BP99 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8BP99 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8BP99 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8BP99 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8BP99 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8BP99 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8BP99 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8BP99 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8BP99 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8BP99 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8BP99 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8BP99 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8BP99 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8BP99 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8BP99 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8BP99 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8BP99 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8BP99 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8BP99 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8BP99 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8BP99 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8BP99 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8BP99 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8BP99 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8BP99 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8BP99 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8BP99 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8BP99 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8BP99 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8BP99 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8BP99 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8BP99 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8BP99 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8BP99 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8BP99 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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