Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms