Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJQ2

Usp1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp1Q8BJQ2 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp1Q8BJQ2 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms