Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJL0

Smarcal1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcal1Q8BJL0 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcal1Q8BJL0 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcal1Q8BJL0 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcal1Q8BJL0 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcal1Q8BJL0 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcal1Q8BJL0 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcal1Q8BJL0 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcal1Q8BJL0 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcal1Q8BJL0 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcal1Q8BJL0 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcal1Q8BJL0 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcal1Q8BJL0 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcal1Q8BJL0 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcal1Q8BJL0 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcal1Q8BJL0 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcal1Q8BJL0 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcal1Q8BJL0 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcal1Q8BJL0 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcal1Q8BJL0 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcal1Q8BJL0 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcal1Q8BJL0 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcal1Q8BJL0 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcal1Q8BJL0 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcal1Q8BJL0 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcal1Q8BJL0 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcal1Q8BJL0 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcal1Q8BJL0 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcal1Q8BJL0 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcal1Q8BJL0 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcal1Q8BJL0 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcal1Q8BJL0 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcal1Q8BJL0 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcal1Q8BJL0 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcal1Q8BJL0 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcal1Q8BJL0 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smarcal1Q8BJL0 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcal1Q8BJL0 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcal1Q8BJL0 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcal1Q8BJL0 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcal1Q8BJL0 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcal1Q8BJL0 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcal1Q8BJL0 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcal1Q8BJL0 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcal1Q8BJL0 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcal1Q8BJL0 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcal1Q8BJL0 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcal1Q8BJL0 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcal1Q8BJL0 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcal1Q8BJL0 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcal1Q8BJL0 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcal1Q8BJL0 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcal1Q8BJL0 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcal1Q8BJL0 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcal1Q8BJL0 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcal1Q8BJL0 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcal1Q8BJL0 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcal1Q8BJL0 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcal1Q8BJL0 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcal1Q8BJL0 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcal1Q8BJL0 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcal1Q8BJL0 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcal1Q8BJL0 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcal1Q8BJL0 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smarcal1Q8BJL0 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smarcal1Q8BJL0 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smarcal1Q8BJL0 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smarcal1Q8BJL0 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smarcal1Q8BJL0 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smarcal1Q8BJL0 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smarcal1Q8BJL0 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Smarcal1Q8BJL0 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Smarcal1Q8BJL0 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smarcal1Q8BJL0 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Smarcal1Q8BJL0 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smarcal1Q8BJL0 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smarcal1Q8BJL0 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smarcal1Q8BJL0 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smarcal1Q8BJL0 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smarcal1Q8BJL0 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smarcal1Q8BJL0 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smarcal1Q8BJL0 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smarcal1Q8BJL0 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smarcal1Q8BJL0 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Smarcal1Q8BJL0 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Smarcal1Q8BJL0 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smarcal1Q8BJL0 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smarcal1Q8BJL0 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smarcal1Q8BJL0 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Smarcal1Q8BJL0 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smarcal1Q8BJL0 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smarcal1Q8BJL0 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smarcal1Q8BJL0 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smarcal1Q8BJL0 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smarcal1Q8BJL0 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smarcal1Q8BJL0 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smarcal1Q8BJL0 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smarcal1Q8BJL0 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smarcal1Q8BJL0 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smarcal1Q8BJL0 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smarcal1Q8BJL0 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms